はじめに
lmfitは非線形最小二乗法を用いてカーブフィットするためのライブラリであり、Scipy.optimize.curve_fitの拡張版に位置する。ここでは、lmfitでデータを多項式モデルによりカーブフィッティングする方法について説明する。
コード
解説
モジュールのインポートなど
バージョン
データの生成
yデータはf(x,a,b,c,d)で定義した関数で作成する。rng = default_rng()とし、rng.random(20)でランダムデータを作成しyデータのノイズとする。xとyの関係を図で示すと以下のようになる。
モデルの定義
lmfit.models
の PolynomialModel
をモデル関数として用いる。ここではdegree=3として、3次式をモデルとした。次数の最大数は7となっている。
初期パタメータの推定
model.guess(y, x=x)
により、上図のデータを3次関数で近似するためのフィッティングパラメータについて、初期値を推定する。パラメータ(params)は以下のようになる。
カーブフィット
model.fit(y, params, x=x)
により、カーブフィッティングを実行する。
フィッティング結果の表示
print(result.fit_report())
により、フィッティングの結果を見ることができる。
result.plot_fit()
によりデータとフィッティングカーブが表示される。
result.plot()
とすることで残差とともにフィッティング結果が表示される。
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コードをダウンロード(.ipynbファイル)
参考
Built-in Fitting Models in the models module — Non-Linear Least-Squares Minimization and Curve-Fitting for Python
Random Generator — NumPy v2.2 Manual
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